A számlatartalék az a pénzösszeg, amelyet félreteszünk a PayPal-számláján annak érdekében, hogy biztosan teljesíteni tudja a visszaterhelésekből, reklamációkból vagy banki visszavonásokból eredő kötelezettségeit, ha más pénz nem áll rendelkezésére. A visszatartott összeg továbbra is az Öné, de nem érhető el (és nem is utalható át).

Ha a számláján van tartalék, és visszaterhelést vagy vitát kap, az adott összeget levonjuk az elérhető egyenlegéről. Ha azonban megszünteti a vállalkozását, vagy már nem dolgoz fel PayPal-kifizetéseket, a tartalék teljes összegét a jövőbeli kifizetés-visszavonások fedezésére fogjuk felhasználni.

Üzleti PayPal-számláján kétféle tartalékot helyezhetünk el: gördülő tartalékot és kötelező tartalékot (egyszerre egyet, vagy a kettő kombinációját).

A gördülő tartalék olyan tartalék, amelynél egy adott napon minden egyes tranzakcióból beérkezett összeg bizonyos százalékát visszatartjuk, majd később, egy adott ütemezés szerint feloldunk. Előfordulhat például, hogy a tartalék 10%-ra és 90 napos gördülő időszakra van beállítva. Ez azt jelenti, hogy az 1. napon beérkezett pénz 10%-át visszatartjuk, majd a 91. napon feloldjuk, a 2. napon beérkezett pénz 10%-át a 92. napig tartjuk vissza, stb. A gördülő tartalék a leggyakoribb tartaléktípus.

A kötelező tartalék az a meghatározott minimális pénzösszeg, amelynek elérhetőnek kell lennie az üzleti PayPal-számlája egyenlegén. A kötelező tartalék százalékos érték lehet, amíg a visszatartott pénz el nem ér egy bizonyos összeget, vagy egy egyszeri összegként határozzuk meg (ezt nevezzük előzetes tartaléknak).

A tartalékokat az elhelyezéstől számított 180 napon belül vizsgáljuk felül. Üzleti teljesítményének javulása alapján előfordulhat, hogy töröljük a tartalékot a számlájáról, vagy módosítjuk a tartalék összegét.